RNDr. Kateřina Olša Fliegerová, CSc.

Vzdělání

1986-1989 Ústav živočišné fyziologie a genetiky Akademie věd České republiky, Praha, titul CSc.
Disertační práce: Výskyt plasmidů u bachorových bakterií
1980-1986 Universita Palackého, Přírodovědecká fakulta, Olomouc

 

Zaměstnání a pracovní zařazení

1989-dosud Ústav živočišné fysiologie a genetiky Akademie věd České republiky, Praha – Uhříněves, laboratoř anaerobní mikrobiologie, vědecký pracovník

 

Hlavní vědecké zájmy

věnuji se spolu s kolegy studiu mikroorganismů zažívacího traktu savců se zvláštním zaměřením na mikrobiologii bachoru přežvýkavců. Mezi mikroorganismy osidlujícími bachor, ke kterým patří bakterie, archeae, protozoa a houby, věnuji zvláštní pozornost anaerobním bachorovým houbám, které jsou z biochemického i fyziologického hlediska výjimečné a zcela mimořádné organismy. V naší laboratoři se zabýváme jejich izolací, charakterizací a diferenciací pomocí metod molekulární biologie. Výjimečné hydrolytické schopnosti bachorových mikroorganismů se snažíme využít i pro biotechnologické účely. Zabýváme se mikrobiologií bioplynových fermentorů a pokoušíme se pomocí anaerobních hub zintenzivnit rozklad biomasy s cílem zintenzivnit produkci bioplynu.

 

Členství ve vědeckých společnostech

  • Československá společnost mikrobiologická

Zahraniční stáže

2005 Hokkaido University, Sapporo, Japan
Studium vlastností nové fylogenetické skupiny anaerobních bakterií Selenomonas ruminantium
1996 The Auburn University, U.S.A.
Studium anaerobní mikrobiální populace ve slepém střevu drůbeže
1993 The Rowett Research Institute, Aberdeen, Scotland, U.K.
Studium plasmidů u bachorových kmenů Selenomonas ruminantium

 

Vybrané publikace

2014 Gruninger, RJ, Anil K. Puniya, AK, Callaghan, TM, Edwards, JE, Youssef, N, Dagar, SS, Fliegerova, K, Griffith, GW, Forster, R, Tsang, A, McAllister, T, Elshahed, MS. 2014. Anaerobic Fungi (Phylum Neocallimastigomycota):Advances in understanding of their taxonomy, life cycle, ecology, role, and biotechnological potential. FEMS Microbiol. Ecol. 90,1,1-17.
DOI: 10.1111/1574-6941.12383
  Schoch, CL, Robbertse, B, Robert, V, Vu, D, Cardinali, G, et al. Finding needles in haystacks: linking scientific names, reference specimens and molecular data for Fungi. Database-The Journal Of Biological Databases And Curation, Article Number: bau061,
DOI: 10.1093/database/bau061 (2014)
  Leis S, Dresch P, Peintner U, Fliegerová K, Sandbichler AM, Insam H, Podmirseg SM. 2014. Finding a robust strain for biomethanation: Anaerobic fungi (Neocallimastigomycota) from the Alpine ibex (Capra ibex) and their associated methanogens. 2014, 29, Anaerobe. 2014 Oct;29:34-43.
doi: 10.1016/j.anaerobe.2013.12.002.
  Fliegerova, K., Tapio, I., Bonin, A., Mrazek, J., Callegari, M., Bani, P., Bayat, A., Vilkki, J., Kopečný, J., Shingfield, K.J., Boyer, F., Coissac, E., Taberlet, P., Wallace, R.J. 2014. Effect of DNA extraction and sample preservation method on rumen bacterial population, Anaerobe, 29, 80-84.
doi.org/10.1016/j.anaerobe.2013.09.015;
2011 Prochazka, J., Mrazek, J., Štrosová, L., Fliegerová, K., Zábranská, J., Dohányos, M. 2012. Enhanced biogas yield from energy crops with rumen anaerobic fungi. Eng. Life Sci. 12, 3, 343-351.
  Fliegerova, K., Mrazek, J., Voigt, K. 2012. Gut fungi: Classification, evolution, life style and application. In: Fungi: Types, environmental impact and role in desease. Editors: A.P. Silva and M. Sol, pp. 3-20. Hauppauge, New York, USA: Nova Science Publisher Inc; ISBN 978-1-61942-671-9 (Hardcover book), 978-1-61942-685-6 (e-book)
  Schoch, C. L., Seifert, K.A., Huhndorf, S., Robert, V., Spouge,J.L., Levesque,C.A.,Chen,W.,and Fungal Barcoding Consortium. 2012. Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi. PNAS 109 (16), 6241-6246.
doi: 10.1073/pnas.1117018109
  Rosero, J.A., Strosova, L., Mrazek, J., Fliegerova, K., Kopečny J. 2012. PCR detection of uncultured rumen bacteria. Folia Microbiologica, 57: 325-330.
  Fliegerová, K., Procházka, J., Mrázek, J., Novotná, Z., Štrosová, L., Dohanyos, M. Biogas and rumen fungi. In: Litonjua et al. editors. Biogas: production, consumption and applications. Hauppauge, New York, USA: Nova Science Publisher Inc; 2012; pp. 161-179, ISBN 978-1-61470-973-2 (Hardcover book), ISBN 978-1-62100-023-5 (e-book)
  Fliegerova, K. , Mrazek, J., Kajan. M., Podmirseg, S.M., Insam, H. 2012.The Effect of maize silage as co-substrate for swine manure on the bacterial community structure in biogas plants. Folia Microbiologica, 57: 281-284.
2010 M. Eckart, K. Fliegerová, K. Hoffmann, K. Voigt. Molecular identification of anaerobic rumen fungi. In: Molecular Identification of Fungi, pp. 297 – 313, Y. Gherbawy, K. Voigt (Eds.), Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2010.
  Griffith GW, Baker S, Fliegerova K, Liggenstoffer A, van der Giezen M, Voigt K, Beaks G. 2010. Anaerobic fungi: Neocallimastigomycota. IMA Fungus 1, 181-185
  J. Mrázek, I. Koppová, J. Kopečný, J. Šimůnek, K. Fliegerová. 2010. PCR-DGGE-based study of fecal microbial stability during the long-term chitosan supplementation of human. Folia Microbiologica, 55: 352-358.
  Z. Novotná, J. Procházka, J. Šimůnek, K. Fliegerová . 2010. Xylanases of anaerobic fungus Anaeromyces mucronatus. Folia Microbiologica, 55: 363-367.
  K. Fliegerová, J.Mrázek,K.Hoffmann, J. Zábranská, K.Voigt. 2010. Diversity of anaerobic fungi within cow manure determined by ITS1 analysis. Folia Microbiologica, 55: 319-325.
2008 J. Kopečný, J. Mrázek, K.Fliegerová, P. Fruhauf, L. Tuckova. 2008. The intestinal microflora of childhood patients with indicated celiac disease. Folia Microbiologica 53:214-216.
  J. Mrázek, L. Štrosová, K .Fliegerová, T. Kott, J. Kopečný. 2008. Diversity of insect intestinal microflora. Folia Microbiologica 53: 229-233.
  I.Koppová, Z.Novotná, L.Štrosová, K. Fliegerová. 2008. Analysis of fatty acid composition of anaerobic rumen fungi. Folia Microbiologica 53: 217-220
  Z.Novotná, K.Fliegerová, J.Šimůnek. 2008. Characterization of chitinases of anaerobic polycentric rumen fungi . Folia Microbiologica 53: 241-245
  K.Fliegerová, K.Hoffmann, J.Mrázek, K.Voigt. 2008. The design of oligonucleotide primers for the universal amplification of the N-acetylglucosaminidase gene (nag1) in Chytridiomycetes with emphasis on the anaerobic Neocallimastigales. Folia Microbiologica 53: 209-213
2006 K.Fliegerová, K.Voigt. 2006. Molecular phylogeny of the Neocallimastigales (Mycota) based on ribosomal RNA genes: exploring the root of the fungal kingdom. Reproduction Nutrition Development 46: S14-S15.
  Fliegerová, K., Mrázek, J., Voigt, K. 2006. Differentiation of Anaerobic Polycentric Fungi by rDNA PCR-RFLP. Folia Microbiologica, 51: 273-277
2004 Fliegerová, K., Hodrová, B., Voigt, K. 2004. Classical and molecular approaches as a powerful tool for the characterization of rumen polycentric fungi. Folia Microbiologica 49: 157-164