RNDr. Martina Johnson Pokorná, Ph.D.

Vzdělání

2011-dosud postdoktorand
Katedra ekologie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze
2007-2011 Ph.D.
Katedra zoologie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze a Laboratoř genetiky ryb, ÚŽFG AV ČR, v.v.i,
disertační práce s názvem „Evoluce způsobů určování pohlaví a genomů u šupinatých plazů (Reptilia: Squamata)”
2009 RNDr.
Katedra zoologie, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze
2002-2007 Mgr.
obor biologie, zaměření Genetika volně žijících živočichů, Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze.
Diplomová práce: „Karyotypová evoluce u ještěrů čeledi Eublepharidae, skupiny s různými způsoby determinace pohlaví“

 

Zaměstnání a pracovní zařazení

2011-dosud postdoktorand; Laboratoř genetiky ryb ÚŽFG AV ČR, v.v.i., Liběchov
1999-2006 laboratorní technik; Ústav histologie a embryologie, 1. Lékařská fakulta, Univerzita Karlova v Praze

 

Hlavní vědecké zájmy

Hlavním zaměřením našeho výzkumu je studium evoluce mechanismů určování pohlaví; tedy jednoho z nejzákladnějších evolučních procesů, klíčových pro vývoj jednotlivce, stejně jako pro ustanovení vyrovnaného poměru pohlaví v populaci. Jako modelová skupina pro tento typ výzkumu nám slouží především plazi (Sauropsida), kteří mají velkou variabilitu ve způsobech určování pohlaví. U některých druhů je pohlaví jedince určeno vnějšími podmínkami a pohlavní chromozomy nejsou přítomny, zatímco jiné linie mají dobře diferencované pohlavní chromozomy typu XX/XY či ZZ/ZW. Téma evoluce pohlavně determinačních mechanismů a diferenciace pohlavních chromosomů řešíme s použitím rozličných metod klasické i molekulární cytogenetiky, jako je např. využití fluorescenční in situ hybridizace, laserové mikrodisekce nebo sortování chromosomů na průtokovém cytometru. Podobným přístupem řešíme také otázky evoluce uspořádání genomu napříč fylogenetickým spektrem jednotlivých linií obratlovců.

 

Zahraniční stáže

2008, 2009, 2010, 2011 Molecular Cytogenetics Laboratory, Centre for Veterinary Science, Department of Veterinary Medicine, University of Cambridge, Velká Británie (celkem 10 měsíců)
2009 CIBIO – Research Centre in Biodiversity and Genetic Resources, Porto –Vairao, Portugalsko (tři týdny)
2008 Department Systematics and Evolution, Muséum National d’Histoire Naturelle, Paříž, Fracie (dva týdny)

 

Vědecké spolupráce

Willem Rens, Malcolm Ferguson-Smith Department of Veterinary Medicine, University of Cambridge, Velká Británie
Eduard Kejnovský Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i., Brno
Massimo Giovannoti, Vincenzo Caputo, Ettore Olmo Università Politecnica delle Marche, Ancona, Itálie
Vladimir Trifonov Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine SB RAS, Novosibirsk, Rusko
Karen Ventura Instituto de Biociências, Universidade de São Paulo, São Paulo, Brazílie

 

Pedagogická činnost

  • Kurz pro magisterské studenty „Evoluce genomu“, Katedra ekologie, PřF UK
  • Konzultantkou dvou studentek Ph.D. a jedné studentky Bc. studia na Katedře ekologie, PřF UK; v minulosti konzultantkou dvou obhájených bakalářských a dvou obhájených magisterských prací

 

Granty

  • hlavní řešitelka 4 projektů (GAUK, Thermal adaptation in ectotherms - European Science Foundation, Synthesys)
  • člen řešitelského týmu 3 projektů (GAČR, GAUK)

 

Další kvalifikace

  • Osvědčení o odborné způsobilosti k navrhování pokusů a projektů pokusů podle § 15d odst. 3 zákona č. 246/1992 Sb., na ochranu zvířat proti týrání. Evidenční číslo: CZ 02529
  • Certifikát o absolvovaném školení na operátora fluorescenčního cytometru BD FACS Aria III cell sorter a BD FACS Diva 6.1.3 software

 

Vybrané publikace

2014 Johnson Pokorná M, Kratochvíl L (2014) What was the ancestral sex-determining mechanism in amniote vertebrates? Biological Reviews
DOI: 10.1111/brv.12156
  Koubová M, Johnson Pokorná M, Rovatsos M, Farkačová K, Altmanová M, Kratochvíl L (2014) Sex determination in madagascar geckos of the genus Paroedura (Squamata: Gekkonidae): are differentiated sex chromosomes indeed so evolutionary stable? Chromosome Research 22: 441-452
  Rovatsos M, Altmanová M, Johnson Pokorná M, Kratochvíl L (2014) Novel X-linked genes revealed by qPCR in the Green Anole, Anolis carolinensis. G3: Genes Genomes Genetics 114.014084
odkaz
  Johnson Pokorná M, Rovatsos M, Kratochvíl L (2014) Sex chromosomes and karyotype of the (nearly) mythical creature, the Gila Monster, Heloderma suspectum (Squamata: Helodermatidae). Plos One 9 e104716
odkaz
  Pokorná M, Altmanová M, Kratochvíl L (2014) Multiple sex chromosomes in the light of female meiotic drive in amniote vertebrates. Chromosoe Research 22: 35-44
odkaz
  Pokorná M, Rens W, Rovatsos M, Kratochvíl L (2014) A ZZ/ZW sex chromosome system in the Thick-Tailed Gecko (Underwoodisaurus milii; Squamata: Gekkota: Carphodactylidae), a member of the ancient gecko lineage. Cytogenetic and Genome Research 142: 190-196
  Rovatsos M, Altmanová M, Pokorná M, Kratochvíl L (2014) Conserved sex chromosomes across adaptively radiated Anolis lizards. Evolution 68: 2079-2085
  Rovatsos M, Pokorná M, Altmanová M, Kratochvíl L (2014) Cretaceous park of sex determination: sex chromosomes are conserved across iguanas. Biology Letters 10: 20131093
2012 Pokorná M, Giovannotti M, Kratochvíl L, Caputo V, Olmo E, Ferguson-Smith MA, Rens W. Conservation of chromosomes syntenic with avian autosomes in squamate reptiles revealed by comparative chromosome painting. Chromosoma 121: 409-418
2011 Pokorná M, Kratochvíl L, Kejnovský E. Microsatellite distribution on sex chromosomes at different stages of heteromorphism and heterochromatinization in two lizard species (Squamata: Eublepharidae: Coleonyx elegans and Lacertidae: Eremias velox). BMC Genetics 12: 91
odkaz
  Pokorná M, Giovannotti M, Kratochvil L, Kasai F, Trifonov VA, O'Brien PCM, Caputo V, Olmo E, Ferguson-Smith MA, Rens W. Strong conservation of the bird Z chromosome in reptilian genomes is revealed by comparative painting despite 275 My divergence. Chromosoma 120: 455-468
2010 Pokorná M, Rábová M, Ráb P, Ferguson-Smith MA, Rens W, Kratochvíl L. Differentiation of sex chromosomes and karyotypic evolution in the eye-lid geckos (Squamata: Gekkota: Eublepharidae), a group with different modes of sex determination. Chromosome Research 18: 809–820
2009 Pokorná M, Kratochvíl L. Phylogeny of sex-determining mechanisms in squamate reptiles: Are sex chromosomes an evolutionary trap? Zoological Journal of the Linnean Society 156: 168-183