RNDr. Silvia Marková, Ph.D.

Strukturovaný životopis

2011-dosud Vědecký pracovník, Laboratoř genetiky ryb ÚŽFG AVČR, v. v. i., Liběchov
2006-2010 Postdoktorand, Laboratoř genetiky ryb, ÚŽFG AVČR, v. v. i., Liběchov
2007 Postdoktorand, Laboratoř Dr. Dufresne, Rimouski, Univerzita Quebec, Kanada
2001-2006 Ph.D., Katedra Ekologie, Přírodovědecká fakulta, UK v Praze
1996-2001 Magistr, Přírodovědecká fakulta, Univerzita PJŠ, Košice

 

Hlavní vědecké zájmy

  • Genetická adaptace temperátních obratlovců (ryb a hrabošů–norníků) na změny klimatu a evoluční biologie arktických perlooček komplexu Daphnia pulex (včetně příčin geografické variability způsobu reprodukce a důsledků kolonizace mezi Amerikou a Eurasií).
  • V grantových projektech, které řeší náš tým vedený Petrem Kotlíkem, jsem zodpovědná za vývoj a implementaci genomických a transkriptomických metod.

 

Granty

2011-2015 Řešitel: Adaptivní genomová divergence v klimatických refugiích, GAČR P506/11/1872
2009-2013 Řešitel: Molekulární adaptace na klimatické změny, GAAV IAA600450901
2009-2011 Hlavní řešitel: Mezikontinentální kolonizace jako důsledek globální změny klimatu: fylogeografická studie holarktické perloočky Daphnia pulicaria, (GAAV) KJB600450901

 

Zahraniční stáže

2003-2007 Univerzita Quebec v Rimouski, Kanada: genetické rozdíly mezi barevnými morfotypy perloočky Daphnia pulicaria z evropských alpských jezer, phylogenetické vztahy a geografická parthenogeneze evropských perlooček Daphnia pulicaria
2000 Aristotelova Univerzita v Tessalonikách, Řecko: monitorování tekoucích vod v Evropě

 

Vybrané publikace

2015 Filipi, K., Marková, S., Searle, J.B., Kotlík, P. Mitogenomic phylogenetics of the bank vole Clethrionomys glareolus, a model system for studying end-glacial colonization of Europe. Molecular Phylogenetics and Evolution 82, 245-257
2014 Bendová, K., Marková, S., Searle, J.B., Kotlík, P. The complete mitochondrial genome of the bank vole Clethrionomys glareolus (Rodentia: Arvicolinae). Mitochondrial DNA. Epub ahead of print 17 January 2014. doi: 10.3109/19401736.2013.873927
  Kotlík, P., Marková, S., Vojtek, L., Stratil, A., Šlechta, V., Hyršl, P., Searle, J.B. Adaptive phylogeography: functional divergence between haemoglobins derived from different glacial refugia in the bank vole. Proceedings of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences 281, 1471-2954
  Marková, S., Searle, J.B., Kotlík, P. Relaxed functional constraints on triplicate α-globin gene in the bank vole suggest different evolutionary history from other rodents. Heredity 113, 64–73
2013 Marková, S., Dufresne, F., Manca, M., Kotlík, P. Mitochondrial capture misleads about the ecological speciation in the Daphnia pulex complex. PLOS ONE 8, e69497
2011 Dufresne, F., Marková, S., Vergilino, R., Ventura, M., Kotlík, P. Diversity in the reproductive modes of European Daphnia pulicaria deviates from the geographical parthenogenesis. PLOS ONE 6, e20049
  Vergilino, R., Marková, S., Ventura, M., Manca, M., Dufresne, F. Reticulate evolution of the Daphnia pulex complex as revealed by nuclear markers. Molecular Ecology 20, 1191-1207
  Fadda, A., Marková, S., Kotlík, P., Luglie, A., Padedda, B., Buscarinu, P., Sechi, N., Manca, M. First record of planktonic crustaceans in Sardinian reservoirs. Biológia 66, 856-865
2010 Marková, S., Šanda, R., Crivelli, A., Shumka, S., Wilson, I.F., Vukić, J., Berrebi, P., Kotlík, P. Nuclear and mitochondrial DNA sequence data reveal the evolutionary history of Barbus (Cyprinidae) in the ancient lake systems of the Balkans. Molecular Phylogenetics and Evolution 55, 488-500
  Musilová, R., Zavadil, V., Marková, S., Kotlík P., Relics of the Europe's warm past: Phylogeography of the Aesculapian snake. Molecular Phylogenetics and Evolution, 57, 1245-1252
  Wójcik, J.M., Kawałko, A., Marková, S., Searle, J.B., Kotlík, P. Phylogeographic signatures of post-glacial colonization from high-latitude refugia: a case study of bank voles using museum specimens. Journal of Zoology 281, 249-262
2009 Searle, J.B., Kotlík, P., Rambau, R.V., Marková, S., Herman, J.S., McDevitt, A.D. The Celtic fringe of Britain: insights from small mammal phylogeography. Proceedings of the Royal Society of London. Series B: Biological Sciences 276, 4287-4294
2008 Kotlík, P., Marková, S., Choleva, L., Bogutskaya, N.G., Ekmekci, F.G., Ivanova, P.P. Divergence with gene flow between Ponto-Caspian refugia in an anadromous cyprinid Rutilus frisii revealed by multiple gene phylogeography. Molecular Ecology 17, 1076-1088
2007 Marková, S., Dufresne, F., Rees, D.J., Černý, M., Kotlík, P. Cryptic intcontinental colonization in water fleas Daphnia pulicaria inferred from phylogenetic analysis of mitochondrial DNA variation. Molecular Phylogenetics and Evolution 44, 42-52
2006 Marková, S., Černý, M., Rees, D.J., Stuchlík , E. Are they still viable? Physical conditions and abundance of Daphnia pulicaria resting eggs in sediment cores from lakes in the Tatra Mountains. Biológia, 61: S135-S146