Mgr. Helena Kupcová Skalníková, Ph.D.

Vzdělání

2003-2007	postgraduální studium oboru Vývojová biologie, Přírodovědecká fakulta Univerzity Karlovy v Praze
1998-2003	magisterské studium oboru Molekulární biologie a genetika, Přírodovědecká fakulta Masarykovy univerzity v Brně
1995-1998	bakalářské studium oboru Výživa člověka, Lékařská fakulta Masarykovy univerzity v Brně

Zaměstnání a pracovní zařazení

2013-dosud	vědecký pracovník Laboratoře aplikovaných proteomových analýz
2007-2012	postdoktorand Laboratoře biochemie a molekulární biologie zárodečných buněk
2003-2007	PhD student Laboratoře biochemie a molekulární biologie zárodečných buněk, ÚŽFG AV ČR

Hlavní vědecké zájmy

• sekretované proteiny a extracelulární váčky jako zprostředkovatelé mezibuněčné komunikace a potenciální zdroj biomarkerů

• mezibuněčné vztahy v nádorovém mikroprostředí; MeLiM prasečí model melanomu

• vývoj a degenerace nervového systému - změny proteomu, sekretomu a kineomu v průběhu diferenciace nervových kmenových buněk, u Huntingtonovy nemoci a po míšním poranění

Zahraniční pobyty a stáže:

05/2010-06/2010 11/2009-12/2009 07/2008-08/2008	University of California San Diego, Department of Anesthesiology, San Diego, California, USA
05/2007-11/2007	Johns Hopkins University, Bayview Proteomics Group, Baltimore, Maryland, USA
09/2005	University of Southern Denmark, Department of Biochemistry and Molecular Biology, Odense, Denmark

Ocenění

2013	prémie Otto Wichterleho
2012	2. místo v soutěži o nejlepší publikaci ústavu zveřejněnou v roce 2011
2009	3. místo v soutěži o nejlepší publikaci ústavu zveřejněnou v roce 2008
2008	cena Arnolda Beckmana
2008	1. místo v soutěži o nejlepší publikaci ústavu zveřejněnou v roce 2007
2007	cena za nejlepší poster (Řehulka P, Skalníková H, Chmelík J., Gadher SJ, Kovářová H. Quantitation of Intact Proteins Fractionated by ProteomeLab PF 2D System Using Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation (iTRAQ)). EuPA Congress, Valencia, Španělsko
2006	3. místo v soutěži o nejlepší publikaci ústavu zveřejněnou v roce 2005

Vybrané publikace:

2020	Petrenko Y, Vackova I, Kekulova K, Chudickova M, Koci Z, Turnovcova K, Kupcova Skalnikova H, Vodicka P, Kubinova S. A comparative analysis of multipotent mesenchymal stromal cells derived from different sources, with a focus on neuroregenerative potential. Sci Rep. 2020 Mar 9;10(1):4290. doi: 10.1038/s41598-020-61167-z.
	Bravo-Hernandez M, Tadokoro T, Navarro MR, Platoshyn O, Kobayashi Y, Marsala S, Miyanohara A, Juhas S, Juhasova J, Skalnikova H, Tomori Z, Vanicky I, Studenovska H, Proks V, Chen P, Govea-Perez N, Ditsworth D, Ciacci JD, Gao S, Zhu W, Ahrens ET, Driscoll SP, Glenn TD, McAlonis-Downes M, Da Cruz S, Pfaff SL, Kaspar BK, Cleveland DW, Marsala M. Spinal subpial delivery of AAV9 enables widespread gene silencing and blocks motoneuron degeneration in ALS. Nature Medicine. 2020 Jan;26(1):118-130. doi: 10.1038/s41591-019-0674-1
	Kupcova Skalnikova H, Vodickova Kepkova K, Vodicka P. Luminex xMAP Assay to Quantify Cytokines in Cancer Patient Serum. Methods in Molecular Biology. 2020;2108:65-88. doi: 10.1007/978-1-0716-0247-8_6.
2019	Kučera J, Strnadová K, Dvořánková B, Lacina L, Krajsová I, Štork J, Kovářová H, Skalníková HK, Vodička P, Motlík J, Dundr P, Smetana K Jr, Kodet O. Serum proteomic analysis of melanoma patients with immunohistochemical profiling of primary melanomas and cultured cells: Pilot study. Oncology Reports. 2019 Nov;42(5):1793-1804. doi: 10.3892/or.2019.7319.
	Horak V, Palanova A, Cizkova J, Miltrova V, Vodicka P, Kupcova Skalnikova H. Melanoma-Bearing Libechov Minipig (MeLiM): The Unique Swine Model of Hereditary Metastatic Melanoma. Genes (Basel). 2019 Nov 9;10(11). pii: E915. doi: 10.3390/genes10110915. Review.
	Skalnikova HK, Bohuslavova B, Turnovcova K, Juhasova J, Juhas S, Rodinova M, Vodicka P. Isolation and Characterization of Small Extracellular Vesicles from Porcine Blood Plasma, Cerebrospinal Fluid, and Seminal Plasma. Proteomes. 2019 Apr 25;7(2). pii: E17. doi: 10.3390/proteomes7020017.
	Řehořová M, Vargová I, Forostyak S, Vacková I, Turnovcová K, Kupcová Skalníková H, Vodička P, Kubinová Š, Syková E, Jendelová P. A Combination of Intrathecal and Intramuscular Application of Human Mesenchymal Stem Cells Partly Reduces the Activation of Necroptosis in the Spinal Cord of SOD1G93A Rats. Stem Cells Translational Medicine. 2019 Jun;8(6):535-547. doi: 10.1002/sctm.18-0223.
2018	Evers MM, Miniarikova J, Juhas S, Vallès A, Bohuslavova B, Juhasova J, Skalnikova HK, Vodicka P, Valekova I, Brouwers C, Blits B, Lubelski J, Kovarova H, Ellederova Z, van Deventer SJ, Petry H, Motlik J, Konstantinova P. AAV5-miHTT Gene Therapy Demonstrates Broad Distribution and Strong Human Mutant Huntingtin Lowering in a Huntington's Disease Minipig Model. Molecular Therapy. 2018 Sep 5;26(9):2163-2177. doi: 10.1016/j.ymthe.2018.06.021.
2017	Kupcova Skalnikova H, Cizkova J, Cervenka J, Vodicka P. Advances in Proteomic Techniques for Cytokine Analysis: Focus on Melanoma Research. Int. Journal of Molecular Sciences. 2017 Dec 13;18(12). pii: E2697. doi: 10.3390/ijms18122697.
2015	Valekova I, Skalnikova HK, Jarkovska K, Motlik J, Kovarova H. Multiplex immunoassays for quantification of cytokines, growth factors, and other proteins in stem cell communication. Methods in Molecuar Biology. 2015;1212:39-63. doi: 10.1007/7651_2014_94.
2013	Kupcova Skalnikova H. Proteomic techniques for characterisation of mesenchymal stem cell secretome. Biochimie. 2013 Dec;95(12):2196-211. doi: 10.1016/j.biochi.2013.07.015.
	Kupcova Skalnikova H, Navarro R, Marsala S, Hrabakova R, Vodicka P, Gadher SJ, Kovarova H, Marsala M. Signaling proteins in spinal parenchyma and dorsal root ganglion in rat with spinal injury-induced spasticity. Journal of Proteomics. 2013 Oct 8;91:41-57. doi: 10.1016/j.jprot.2013.06.028.
2011	Sheng S, Skalnikova H, Meng A, Tra J, Fu Q, Everett A, Van Eyk J. Intact protein separation by one- and two-dimensional liquid chromatography for the comparative proteomic separation of partitioned serum or plasma. Methods in Molecular Biology. 2011;728:29-46. doi: 10.1007/978-1-61779-068-3_2.
	Skalnikova H, Motlik J, Gadher SJ, Kovarova H. Mapping of the secretome of primary isolates of mammalian cells, stem cells and derived cell lines. Proteomics. 2011 Feb;11(4):691-708. doi: 10.1002/pmic.201000402.
	Jarkovska K, Kupcova Skalnikova H, Halada P, Hrabakova R, Moos J, Rezabek K, Gadher SJ, Kovarova H. Development of ovarian hyperstimulation syndrome: interrogation of key proteins and biological processes in human follicular fluid of women undergoing in vitro fertilization. Molecular Human Reproduction. 2011 Nov;17(11):679-92. doi: 10.1093/molehr/gar047. Epub 2011 Jun 22.
	Skalnikova H, Martinkova J, Hrabakova R, Halada P, Dziechciarkova M, Hajduch M, Gadher SJ, Hammar A, Enetoft D, Ekefjard A, Forsstrom-Olsson O, Kovarova H. Cancer drug-resistance and a look at specific proteins: Rho GDP-dissociation inhibitor 2, Y-box binding protein 1, and HSP70/90 organizing protein in proteomics clinical application. Journal of Proteome Research. 2011 Feb 4;10(2):404-15. doi: 10.1021/pr100468w.
2008	Skalnikova H, Vodicka P, Pelech S, Motlik J, Gadher SJ, Kovarova H. Protein signaling pathways in differentiation of neural stem cells. Proteomics. 2008 Nov;8(21):4547-59. doi: 10.1002/pmic.200800096.
	Skalnikova H, Vodicka P, Gadher SJ, Kovarova H. Proteomics of neural stem cells. Expert Review of Proteomics. 2008 Apr;5(2):175-86. doi: 10.1586/14789450.5.2.175. Review.
2007	Skalnikova H, Halada P, Vodicka P, Motlik J, Rehulka P, Hørning O, Chmelik J, Nørregaard Jensen O, Kovarova H. A proteomic approach to studying the differentiation of neural stem cells. Proteomics. 2007 Jun;7(11):1825-38.
2004	Skalníková H, Freiberger T, Chumchalová J, Grombiríková H, Sedivá A. Cost-effective genotyping of human MBL2 gene mutations using multiplex PCR. Journal of Immunol Methods. 2004 Dec;295(1-2):139-47. Epub 2004 Nov 11.

Popularizační práce

2019	Vanek P., Kupcová Skalníková H. Extracelulární váčky a jejich biomedicínský potenciál. Bioprospect 4, ročník 29 (2019), str. 82-85.
2019	Palánová A., Kupcová Skalníková H. Nekódující RNA a maligní melanom. Bioprospect 3, ročník 29 (2019), str. 68-71.
2017	Kupcová Skalníková H., Kovářová H. Extracelulární váčky II. Exozomy a jejich význam u patofyziologických stavů člověka. Živa 1 (2017), str. 4-7.
2016	Kupcová Skalníková H. Extracelulární váčky I. Typy váčků a jejich fyziologické úlohy v mezibuněčné komunikaci. Živa 6 (2016), str. 274-277.
2013	Kupcová Skalníková H. Proteinová sekrece buněk savců aneb jak si buňky povídají a jak jim naslouchat. Živa 2 (2013), str. 50-53.
2009	Skalníková H. Proteomika nervových kmenových buněk. In vitro diagnostika, 11 (2009), str.11-12.