Mgr. Petr Vodička, Ph.D.

Petr Vodička obdržel Ph.D. z Vývojové biologie na Přírodovědecké fakultě Karlovy Univerzity v Praze za práci zaměřenou na charakterizaci somatických kmenových buněk u miniaturního prasete (2007). V rámci postdoktorandské pozice na ÚŽFG AVČR, v.v.i. se podílel na vytvoření prasečího transgenního modelu Huntingtonovy nemoci (2007-2011). Ve studiu Huntingtonovy nemoci pokračoval během postdoktorandského pobytu v Laboratoři Prof. Marian DiFiglia na MGH/Harvard medical school, Boston (2011-2016). V současnosti se zaměřuje na studium role autofagie v patogenezi Huntingtonovy nemoci pomocí proteomických a molekulárně biologických metod.

Vzdělání

1994-1999	Magisterské studium na Masarykově univerzitě Brno, obor Molekulární biologie a genetika
2001-2007	Postgraduální studium oboru Vývojová biologie, Karlova univerzita, Praha Doktorská práce: Využití miniaturního prasete pro biomedicínský výzkum kmenových buněk.

Hlavní vědecké zájmy

Využití tkáňově specifických kmenových buněk prasete (nervové a mezenchymové kmenové buňky) pro buněčné terapie poškození CNS.
Příprava prasečích iPS buněk a transgenního modelu Huntingtonovy choroby u prasete.

Ocenění, Granty

2017	Fellowship J.E. Purkyně
2008-2010	Biodegradovatelné hydrofilní materiály pro náhradu měkkých tkání, spoluřešitel
2009	Dediferenciace prasečích somatických kmenových buněk pomocí lentivirových vektorů pro specifické transkripční faktory, Program projektů podpory mezinárodní spolupráce AV ČR M200450971

Členství v odborných společnostech

2008	EHDN (European Huntington´s Disease Network)

Zahraniční pobyty a stáže

02-03/2003	Laboratoř embryonální technologie, Národní ústav agrobiologických věd, Tsukuba, Japonsko. Pobyt v laboratoři Takashi Nagaie, mikromanipulace prasečích embryí a ooc
09-10/2004	Iovská státní univerzita, Ames, USA. Pobyt v laboratoři Dr. Ouredniků, histologie prasečího CNS.
08/2007	Massachusettská všeobecná nemocnice, Boston, USA. Laboratoř Dr. DiFiglie, histologie CNS a imunodetekce huntingtinu v prasečí nervové tkáni.
09-12/2009	Roslinský institut, Roslin, UK. Laboratoř Dr. Burdona, příprava prasečích iPS buněk.
01/2012 – 08/2016	Postdoktorand Marian DiFiglia’s lab, Massachusetts General Hospital a Harvard Medical School, Boston, USA, studium mechanismů patogeneze Huntingtonovy choroby s využitím zvířecích a buněčných modelů HD s cílem identifikovat možnou terapii.

Vybrané publikace

2019	Aviolat H, Pinto RM, Godschall E, Murtha R, Richey HE, Sapp E, Vodicka P, Wheeler VC, Kegel-Gleason KB, DiFiglia M. (2019) Assessing average somatic CAG repeat instability at the protein level. Sci Rep. 2019 Dec 16;9(1):19152. doi: 10.1038/s41598-019-55202-x. PMID: 31844074; PMCID: PMC6915696.
2018	Evers MM, Miniarikova J, Juhas S, Vallès A, Bohuslavova B, Juhasova J, Skalnikova HK, Vodicka P, Valekova I, Brouwers C, Blits B, Lubelski J, Kovarova H, Ellederova Z, van Deventer SJ, Petry H, Motlik J, Konstantinova P. (2018) AAV5-miHTT Gene Therapy Demonstrates Broad Distribution and Strong Human Mutant Huntingtin Lowering in a Huntington's Disease Minipig Model. Mol Ther. 2018 Sep 5;26(9):2163-2177. doi: 10.1016/j.ymthe.2018.06.021. Epub 2018 Jun 25. PMID: 30007561; PMCID: PMC6127509.
	Pfister E, Dinardo N, Mondo E, Borel F, Conroy F, Fraser C, Gernoux G, Han X, Hu D, Johnson E, Kennington L, Liu P, Reid S, Sapp E, Vodicka P, et al. (2018) Artificial miRNAs reduce human mutant Huntingtin throughout the striatum in a transgenic sheep model of Huntington's disease. Hum Gene Ther., Feb 23. doi: 10.1089/hum.2017.199. PubMed PMID: 29207890.
2017	Quinti L, Dayalan Naidu S, Träger U, Chen X, Kegel-Gleason K, Llères D, Connolly C, Chopra V, Low C, Moniot S, Sapp E, Tousley AR, Vodicka P, et al. (2017) KEAP1-modifying small molecule reveals muted NRF2 signaling responses in neural stem cells from Huntington's disease patients. Proc Natl Acad Sci USA. Jun 6;114(23):E4676-E4685.
2011	Devine, Michael J.; Ryten, Mina; Vodicka, Petr; Thomson, Alison J.; Burdon, Tom; Houlden, Henry; Cavaleri, Fatima; Nagano, Masumi; Drummond, Nicola J.; Taanman, Jan-Willem; Schapira, Anthony H.; Gwinn, Katrina; Hardy, John; Lewis, Patrick A., and Kunath, Tilo. (2011) Parkinson's disease induced pluripotent stem cells with triplication of the +α-synuclein locus. Nature Communications [10.1038/ncomms1453] ; (2) 440.
	Kepkova KV, Vodicka P, Toralova T, Lopatarova M, Cech S, Dolezel R, Havlicek V, Besenfelder U, Kuzmany A, Sirard MA, Laurincik J, Kanka J. (2011) Transcriptomic analysis of in vivo and in vitro produced bovine embryos revealed a developmental change in cullin 1 expression during maternal-to-embryonic transition. Theriogenology; Jun;75(9):1582-95.
2010	Usvald D, Vodicka P, Hlucilova J, Prochazka R, Motlik J, Strnadel J, Kucharova K, Johe K, Marsala S, Scadeng M, Kakinohana O, Navarro R, Santa M, Hefferan MP, Yaksh TL, Marsala M. (2010) Analysis of dosing regimen and reproducibility of intraspinal grafting of human spinal stem cells in immunosuppressed minipigs. Cell Transplant. ; 19(9):1103-22
	Studenovská H, Vodička P, Proks V, Hlučilová J, Motlík J, Rypáček F. (2010) Synthetic poly(amino acid) hydrogels with incorporated cell-adhesion peptides for tissue engineering. J Tissue Eng Regen Med. ; Aug;4(6):454-63
2008	Skalnikova H, Vodicka P, Pelech S, Motlik J, Gadher SJ, Kovarova H. (2008) Protein signaling pathways in differentiation of neural stem cells. Proteomics . Nov; 8(21):4547-59.
	Skalnikova H, Vodicka P, Gadher SJ, Kovarova H. (2008) Proteomics of neural stem cells. Expert Rev Proteomics . Apr;5(2):175-86.
	Vodicka P, Hlucilova J, Klima J, Prochazka R, Ourednik J, Ourednik V, Motlik J. (2008) The minipig as animal model in biomedical stem cell research. 241-248. Source Book of Models for Biomedical Research, Ed.: P. Michael Conn, Humana Press.
2007	Skalnikova H, Halada P, Vodicka P, Motlik J, Rehulka P, Hørning O, Chmelik J, Jensen ON, and Kovarova H. (2007) A proteomic approach to studying the differentiation of neural stem cells. Proteomics . Jun;7(11):1825-38.
2006	Vodicka P, Skalnikova H, Kovarova H. (2006) The characterization of stem cell proteomes. Curr Opin Mol Ther . Jun;8(3):232-9.
2005	Vodicka P, Smetana K Jr, Dvorankova B, Emerick T, Xu YZ, Ourednik J, Ourednik V, Motlik J. (2005) The miniature pig as an animal model in biomedical research. Ann N Y Acad Sci . May;1049:161-71.
2004	Prochazka R, Vodicka P, Zudova D, Rybar R, Motlik J. (2004) Development of in vivo derived diploid and tetraploid pig embryos in a modified medium NCSU 37. Theriogenology . Jul;62(1-2):155-64.
2000	Pavlok A, Kanka J, Motlik J, Vodicka P. (2000) Culture of bovine oocytes from small antral follicles in meiosis-inhibiting medium with butyrolactone I: RNA synthesis, nucleolar morphology and meiotic kompetence. Anim Reprod Sci . Dec 1;64(1-2):1-11.
	Vodicka P, Sevcíková S, Smardová J, Soucek K, Smarda J. (2000) The effects of RAR alpha and RXR alpha proteins on growth, viability, and differentiation of v-MYB-transformed monoblasts. Blood Cells Mol Dis . Aug;26(4):395-406.
1999	Smarda J, Zemanova K, Bryja J, Smardova J, Kozubik A, Hofmanova J, Nemajerova A, Sevcikova S, Kohoutek J, Vodicka P. (1999) Retinoid X receptor suppresses transformation by the v-myb oncogene. J Leukoc Biol . Dec;66(6):1039-48.