RNDr. Jörg Bohlen, Ph.D.

Vzdělání

1996-1999 Doktorand, Department of Biology and Ecology of Fishes, Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries, Berlin, Německo
Téma disertační práce: "The autecology of spined loach, Cobitis taenia" with special emphasis on the reproductive biology and ecology of early stages
1993-1994 Magisterské studium, Max-Planck-Institute of Limnology, Plön, Německo
Téma diplomové práce: "in-situ grazing rates of Daphnia during spring in Lake Schöhsee near Plön"
1989-1994 Studium biologie, Carl-von-Ossietzky University Oldenburg, Německo

 

Zaměstnání a pracovní zařazení

1999-dosud Vědecký pracovník, Laboratoř genetiky ryb, ÚŽFG AV ČR, v.v.i., Liběchov

 

Hlavní vědecké zájmy

Mojí původní specializací je zoologie a ekologie. Po krátkém období, kdy jsem se věnoval limnologii, jsem se začal zabývat autekologií různých druhů sladkovodních ryb, kde jsem kombinoval data získaná z přírodních populací s různými experimentálními nastaveními mikrokosmu; modelovým organismem byli zejména sekavci. Výzkum sekavců (Cobitis taenia) poukázal, že se pod tímto druhovým jménem skrývá obrovská diversita včetně geograficky dosti rozšířených unisexuálně se rozmnožujícím linií hybridního původu. Počínaje analýzami sekavců na území Německa a České republiky, přes studium diversity tohoto rodu v Evropě a dále rodů čeledi sekavcovitých (Cobitidae) a jim příbuzných čeledí, se moje práce začala čím dál tím více zaměřovat na studium diversity a evoluční historie sladkovodních ryb Evropy a Asie všeobecně. V současnosti se zabývám zejména analýzou fylogenetických vztahů (na základě molekulárních markerů) v kombinaci s cytogenetickými, morfologickými a geologickými daty za účelem identifikace vlivu různých biogeografických událostí, hybridizace a polyploidizačních událostí, či klimatických, tektonických a geografických změn v průběhu cenozoika. Na základě všech těchto vstupních údajů je možné zrekonstruovat evoluční historii dané skupiny ryb a vyvodit závěry o relativním vlivu různých evolučních mechanismů.

Aktuálně se s dalšími kolegy z LGR věnujeme výzkumu vzniku a ustálení polyploidní linie v evoluci ryb čeledi Botiidae (Cobitoidea). Z důvodů komplikovanosti studovaného problému (zejména díky vysokému odhadovanému stáří polyploidizace) kolektiv laboratoře k jeho řešení využívá více metod –analýzu variability DNA (sekvenace vybraných úseků, určování variability mikrosatelitů) klasické i molekulárně cytogenetické metody či transkiptomiku.

 

Ocenění a stipedia

2012 Cena AV ČR; člen autorského týmu; téma: „Klonální obratlovci: objev, mechanismy,biodiversita a rekonstrukce na modelu sekavcovitých ryb“

 

Členství ve vědeckých společnostech

  • Evropská ichthyologická společnost – člen kolegia
  • Gesellschaft für Ichthyologie
  • Fisheries Society of the British Isles
  • Ichthyological Society of Japan

 

Zahraniční stáže

2006 Museum of Natural History, London, United Kingdom
2006 Raffles Museum of Biodiversity Research, National University, Singapore
2004, 2005 Institut für Evolutionsbiologie, Universität Bonn, Bonn, Germany
2002, 2005 Museo National de Ciences Naturales, Department Biodiversidad y Biología Evolutiva, Madrid, Spain

 

Vybrané publikace

10 vybraných publikací (z celkem ~100)

2014 Geiger M.F., M. T. Monaghan, V. Almada, R. Barbieri, M. Bariche, P. Berrebi, J. Bohlen, M. Casal-Lopez, G. B. Delmastro, G. P. J. Denys, A. Dettai, I. Doadrio, E. Kalogianni, H. Kärst, M. Kottelat, M. Kovačić, M. Laporte, M. Lorenzoni, Z. Marčić, M. Özulu?, A. Perdices, S. Perea, H. Persat, S. Porcelotti, C. Puzzi, J. Robalo, R. Šanda, M. Schneider, V. Šlechtová jr., M. Stoumboudi, S. Walter, J. Freyhof 2014. Spatial Heterogeneity in the Mediterranean Biodiversity Hotspot Affects Barcoding Accuracy of its Freshwater Fishes. Molecular Ecology Resources 14: 1210-1221.
IF 2013: 5.626
2013 Bohlen, J., V. Šlechtová jr. 2013. Two new species of Schistura (Nemacheilidae) from Myanmar. Ichthyological Exploration of Freshwaters 24: 21-30.
IF 2013: 2.275
  Symonová, R., Majtánová, Z., Sember, A., Staaks, G.B.O., Bohlen, J., Freyhof, J., Rábová, M. and Ráb, P. 2013. Genome differentiation in a species pair of coregonine fishes: an extremely rapid speciation driven by stress-activated retrotransposons mediating extensive ribosomal DNA multiplications. BMC Evolutionary Biology 13, 42.
IF 2013: 3.407
2011 Bohlen, J., V. Šlechtová jr., H.H. Tan, R. Britz 2011: Molecular phylogeny of the freshwater fish genus Pangio (Cobitidae: Teleostei): Molecular Phylogenetics and Evolution 61: 854-865.
IF 2010: 3.889      doi: 10.1016/j.ympev.2011.08.003
2008 Šlechtová, V. jr., J. Bohlen, A. Perdices (2008): Molecular phylogeny of the freshwater fish family Cobitidae (Cypriniformes: Teleostei): delimitation of genera, mitochondrial introgression and evolution of sexual dimorphism. Molecular Phylogenetics and Evolution 47: 812-831.
IF 2008: 3.871      doi: 10.1016/j.ympev.2007.12.018
  Perdices, A., Bohlen, J. & I. Doadrio (2008): The molecular diversity of Adriatic spined loaches (Teleostei, Cobitidae). Molecular Phylogenetics and Evolution 46: 382-390.
IF (2008): 3.871      doi: 10.1016/j.ympev.2007.05.007
2006 Bohlen, J., Šlechtová, V.jr., Bogutskaya, N. & J. Freyhof (2006): Across Siberia and over Europe: Phylogenetic relationships of the freshwater fish genus Rhodeus in Europe and the phylogenetic position of R. sericeus from the River Amur. Molecular Phylogenetics and Evolution 40: 856-865.
IF 2006: 3.528      doi:10.1016/j.ympev.2006.04.020
  Bohlen, J., Perdices, A., Doadrio, I. & P. Economides (2006): Vicariance, colonisation and fast local speciation in Asia Minor and the Balkan as revealed from the phylogeny of spined loaches (Osteichthyes; Cobitidae). Molecular Phylogenetics and Evolution 39: 552-561.
IF 2006: 3.528      doi: 10.1016/j.ympev.2005.12.007
  Šlechtová, V. jr., J. Bohlen, J. Freyhof & P. Ráb (2006): Molecular phylogeny of the Southeast Asian freshwater fish family Botiidae (Teleostei: Cobitoidea) and the origin of polyploidy in their evolution. Molecular Phylogenetics and Evolution 39: 529-541.
IF 2006: 3.528      doi: 10.1016/j.ympev.2005.09.018
2004 Šlechtová, V. jr., J. Bohlen, J. Freyhof, H. Persat, G.B. Delmastro 2004: The Alps as barrier to dispersal in cold-adapted freshwater fishes? Phylogeographic history and taxonomic status of the bullhead in the Adriatic freshwater drainage. Molecular Phylogenetics and Evolution 33: 225-239.
IF 2004: 4.213      doi:10.1016/j.ympev.2004.05.005