Vzdělání
| 2016-dosud | UK, Přírodovědecká fakulta doktorské studium, obor: imunologie |
| 2013-2016 | UK, Přírodovědecká fakulta magisterské studium, obor: imunologie |
| 2010-2013 | JČU, Přírodovědecká fakulta bakalářské studium, obor: biologie |
Zaměstnání a pracovní zařazení
| 2016-dosud | ÚŽFG AVČR, Laboratoř anaerobní mikrobiologie Ph.D. student, výzkum lidského mikrobiomu u pacientů s IBD |
| 2016-dosud | Advokátní a patentová kancelář Trpalová-Hakr-Kubát překlady biologických patentů |
| 2014-2016 | MBÚ AVČR, Laboratoř buněčné a molekulární imunologie laboratorní technik, práce se sérovými proteiny (SDS-PAGE, western blot, ELISA). |
| 2011-2013 | MBÚ AVČR, Laboratoř funkční cytologie laboratorní technik, transformace a selekce v buněčných kulturách (fluorescenční mikroskopie, SDS-PAGE, western blot, 2D electroforéza). |
| 2009, 2010 | Výzkumný ústav lesního hospodářství a myslivosti, Útvar biologie a šlechtění lesních dřevin laboratorní technik, práce v DNA laboratoři (izolace DNA, PCR). |
Hlavní vědecké zájmy
Hlavní náplní mé práce je analýza mikrobiálních populací v lidském střevě. Zaměřuji se na interakce mikrobiom-hostitel u IBD pacientů (Crohnova nemoc, ulcerózní kolitida) léčených různými terapiemi jako je biologická léčba, probiotická léčba nebo fekální transplantace. Kromě mikrobiologie se zabývám rovněž imunologickou podstatou onemocnění, kdy sleduji cytokinové profily pacientů ve stolici. Zajímá mě mikrobiom nejen u pacientů, ale i u zdravých jedinců, především pokud má projekt přesah do jiných oborů jako je imunologie nebo bioinformatika.
V naší laboratoři používáme molekulárně biologické metody od jednoduché PCR-DGGE až po vysokokapacitní NGS. K meta-analýze NGS dat používáme různé bioinformatické přístupy s využitím softwarových balíčků jako je QIIME nebo Geneious.
Zahraniční stáže
| 5 měsíců v The Mucosal Immunobiology and Vaccine Center (MIVAC) na University of Gothenburg. stáž v MIVAC laboratoři |
|
| 2015/2016 | 5 měsíců na University of Gothenburg ve Švédsku Erasmus plus study program |
| 2012 | 4 měsíce na Wageningen University v Holandsku Erasmus studijní program |
| 2009/2010 | 1 rok na Johannes Kepler Universität in Linz v Rakousku stáž biologická chemie |