Ing. Kateřina Vodičková Kepková, Ph.D.

Vzdělání

2011 Postgraduální studium na Přírodovědecké fakultě UK v Praze
Školitel: RNDr. Jiří Kaňka Csc.
Téma: Transkriptomika embryonální genomové aktivace preimplantačního vývoje skotu v podmínkách in vivo a in vitro kultivace.

 

Zaměstnání a pracovní zařazení

Postdoktorand  

 

Hlavní vědecké zájmy

  • Zaměření na studium Huntingtonovy nemoci s využitím lidských indukovaných pluripotentních (iPS) buněk and nervových kmenových buněk (NSCs) získaných od pacientů trpících touto chorobou.
  • Vývoj biochemické eseje pro kvantifikaci mutantního proteinu huntingtinu.

 

Klíčové zkušenosti a kvalifikace

  • Genově expresní mikročipy
  • Subtraktivní hybridizace a sekvencování DNA
  • Izolace mRNA, celkové RNA a DNA
  • Real-Time qRT-PCR
  • Analýza mikročipů, real-time qRT-PCR a výsledků sekvencování
  • Tkáňové kultury – embryonální, indukované pluripotentní a nervové kmenové buňky
  • Izolace a in vitro maturace prasečích a kravských oocytů
  • In vitro fertilizace prasečích embryí
  • Western blot
  • Luminex xMAP Assay
  • Imunocytochemie a imunohistochemie

 

Zahraniční stáže

09-10/2006 Centre de Recherche en Biologie de la Reproduction Département de Sciences Animales, Université Laval, Kanada
Účelem stáže byla analýza genové exprese v raných bovinních embryí pomocí mikročipů. Stáž byla zaměřena na přípravu mikročipů (purifikace, amplifikace, značení, hybridizace) a následnou analýzu výsledných dat.

 

Kurzy

29. září–3. října 2008 Instituto Gulbenkian de Cięncia, Oeiras, Portugalsko - MDARB08 Microarray Data Analysis using R and Bioconductor
Praktický trénink:
  • design mikročipových experimentů
  • normalizace dat a kontrola kvality
  • statistická analýza výsledků
  • použité Limma balíčku a dalších R knihoven v Bioconductor

 

Vybrané publikace

2020 Luminex xMAP Assay to Quantify Cytokines in Cancer Patient Serum.
Kupcova Skalnikova H, Vodickova Kepkova K, Vodicka P.
Methods Mol Biol. 2020;2108:65-88. doi: 10.1007/978-1-0716-0247-8_6.
2015 Milan Blaha, Lucie Nemcova, Katerina Vodickova Kepkova, Petr Vodicka, Radek Prochazka. Gene expression analysis of pig cumulus-oocyte complexes stimulated in vitro with follicle stimulating hormone or epidermal growth factor-like peptides. Reprod Biol Endocrinol. 2015 Oct 6;13(1):113. doi: 10.1186/s12958-015-0112-2.
2012 Toralová T, Benešová V, Kepková KV, Vodička P, Šušor A, Kaňka J. Bovine preimplantation embryos with silenced nucleophosmin mRNA are able to develop until the blastocyst stage. Reproduction. 2012 Sep;144(3):349-59. doi: 10.1530/REP-12-0033. Epub 2012 Jun 25.
  Kanka J, Nemcova L, Toralova T, Vodickova-Kepkova K, Vodicka P, Jeseta M, Machatkova M. Association of the transcription profile of bovine oocytes and embryos with developmental potential. Anim Reprod Sci. 2012 Sep;134(1-2):29-35.
doi: 10.1016/j.anireprosci.2012.08.008. Epub 2012 Aug 11.
2011 Katerina Vodickova Kepkova, Petr Vodicka, Tereza Toralova, Miloslava Lopatarova, Svatopluk Cech, Radovan Dolezel, Vitezslav Havlicek, Urban Besenfelder, Anna Kuzmany, Marc-Andre Sirard, Jozef Laurincik, Jiri Kanka. Transcriptomic analysis of in vivo and in vitro produced bovine embryos revealed a developmental change in cullin 1 expression during maternal-to-embryonic transition. Theriogenology. 2011 Jun;75(9):1582-95.
doi: 10.1016/j.theriogenology.2010.12.019. Epub 2011 Mar 15.
2009 I. Petrovičová, F. Strejček, O. Ǿstrup, A. Lucas-Hahn, K. Kepková, H. Niemann, J. Laurinčík, P. Maddox-Hyttel, 2009. Ultrastructural analysis of bovine somatic cell nuclear transfer (SCNT) embryos during the first cell cycle. Slovak J. Anim. Sci., 42, 2009 (3): 144 – 148
  T. Toralová, A. Šušor, L. Němcová, K. Kepková, J. Kaňka (2009) Silencing CENPF in bovine preimplantation embryo induces arrest at 8-cell stage. Reproduction 138:783-791
  Kanka J, Kepkova K, Nemcova L, 2009. Gene expression during minor genome activation in preimplantation bovine development. Theriogenology 72:572-83

 

Popularizační články

2017 Kateřina Vodičková Kepková, Petr Vodička, Jan Motlík. Cells of a Great Potential 3. Medical Use of Induced Pluripotent Stem Cells. Živa 4/2017, page 146
2017 Kateřina Vodičková Kepková, Petr Vodička, Jan Motlík. Cells of a Great Potential 2. Characterization and Use of Induced Pluripotent Stem Cells. Živa 3/2017, page 98
2016 Kateřina Vodičková Kepková, Petr Vodička, Jan Motlík. Cells of a Great Potential 1. History of Induced Pluripotency and Methods of iPS Cell Preparation, Živa 4/2016, page 150